《药师经》是佛经中的经典的经文，也是非常好的一部经文，《药师经》还是一部冥阳两利的经文，不但可以帮助众生脱离苦难、病痛用来超度也是可以的。《药师经》经常用来超度往生者，尤其是往生者因病苦而去世，都会特别的为他诵药师经。
事实上，任何一部佛经都可帮助在世或往生者的健康，诸佛菩萨的福慧两足，不是众生的心可以计测，他们个个都是大医王，所以不用担心往生者的健康问题。倒是往生者的业障能消除，对他在六道轮回的去处或往生西方净土的品位，会有所帮助，更重要的是本来应该下地狱的，也因闻到药师佛的圣号而得解脱地狱之苦，这在《药师经》中，皆有明白的宣示。
我们读《药师经》全文 ，除了解药师佛所发利益众生的十二大愿外，常诵药师佛的圣号或常诵药师经，也可避免九横死，也就是避免病死、火焚、水溺等九种之意外死亡。此外，常念药师佛的圣号，或常诵《药师经》，也会获得十二药叉大将的守护，每位药叉大将各率领七千的眷属，等于修持药师法门就能获得更多的守护。所以，《药师经》是可以用来超度的。
