一、香赞：炉香乍热。法界蒙熏。诸佛海会悉遥闻。
随处结祥云。诚意方殷。诸佛現全身 。
南无香云盖菩萨摩诃萨。(三称)
二、南无本师释迦牟尼佛(三称)
三、净口业真言：
唵。修利修利。摩诃修利。修修利。萨婆诃。
净身业真言：
唵。修多唎。修多唎。修摩唎。修摩唎。娑婆诃。
净意业真言：
唵。嚩日啰怛诃贺斛。
安土地真言：
南无三满多。没駄喃。唵。度噜度噜。地尾娑婆诃。
净三业真言：
唵。娑嚩。婆嚩秫驮。娑嚩达摩娑嚩。婆嚩秫度憾。
普供养真言：
唵 哦yē哦曩 三婆缚wá 伐日啰斛hòng
四、开经偈：
无上甚深微妙法。百千万劫难遭遇。
我今见闻得受持。愿解如来真实义。
五、南无药师会上佛菩萨(三称)
六、诵经：药师经原文
七、七佛灭罪真言： 离婆离婆帝。求诃求诃帝。陀罗尼帝。尼诃啰帝。毗黎你帝。摩诃伽帝。真陵乾帝。莎婆诃。
八、补阙真言：南谟喝啰怛那。哆啰夜耶。佉啰佉啰。俱住俱住。摩啰摩啰。虎啰，吽。贺贺。苏怛拏。吽。泼抹拏。娑婆诃。
九、药师经赞：十二药叉大将。助佛宣弘。五色彩缕结其名。随愿悉圆成。冤业冰清。福寿永康宁。
十、药师大赞：药师佛 延寿王 光临水月坛场
悲心救苦降吉祥 免难消灾障
忏悔众等三世罪 愿祈福寿绵长
吉星高照沐恩光 如意保安康
吉星高照沐恩光 如意保安康
十一、药师偈：药师如来琉璃光 焰网庄严无等伦
无边行愿利有情 各遂所求皆不退
南无东方净琉璃世界消灾延寿药师佛
南无消灾延寿药师佛(数百千声)
南无日光遍照菩萨(三称)
南无月光遍照菩萨(三称)
消病咒： 唵 室哩哆 室哩哆 军咤利 莎婆诃
解冤偈： 解结解结解冤结。 解了多生冤和业。洗心涤虑发虔诚。 今对佛前求解结。药师佛。药师佛 。消灾延寿药师佛。随心满愿药师佛。
忏悔文： 往昔所造诸恶业 皆由无始贪瞋痴
从身语意之所生 一切我今皆忏悔
罪从心起将心忏 心若灭时罪亦亡
心亡罪灭俩俱空 是故名为真忏悔
十方三世一切佛 一切菩萨摩诃萨
摩诃般若波罗密
十二、般若波罗蜜多心经： (唐三藏法师玄奘译)
观自在菩萨，行深般若波罗蜜多时，照见五蕴皆空，度一切苦厄。“舍利子!色不异空，空不异色;色即是空，空即是色。受、想、行、识，亦复如是。舍利子!是诸法空相，不生不灭，不垢不净，不增不减。是故空中无色，无受想行识;无眼耳鼻舌身意，无色声香味触法;无眼界，乃至无意识界;无无明，亦无无明尽，乃至无老死，亦无老死尽;无苦集灭道;无智亦无得。以无所得故，菩提萨埵(duǒ)，依般若波罗蜜多故，心无罣(guà)碍;无罣碍故，无有恐怖，远离颠倒梦想，究竟涅盘。三世诸佛，依般若波罗蜜多故，得阿耨(nò)多罗三藐(miǎo)三菩提。故知般若波罗蜜多，是大神咒，是大明咒，是无上咒，是无等等咒，能除一切苦，真实不虚。故说般若波罗蜜多咒。即说咒曰：揭谛，揭谛，波罗揭谛，波罗僧揭谛，菩提萨婆诃。
十三、愿消三障诸烦恼。愿得智慧真明了。
普愿罪障悉消除。世世常行菩萨道。
十四、诵经功德殊胜行。无边胜福皆回向。
普愿沉溺诸众生。速往无量光佛刹。
十方三世一切佛。一切菩萨摩诃萨。
摩诃波若波罗蜜。
三皈依：自皈依佛。当愿众生。体解大道。发无上心。
自皈依法。当愿众生。深入经藏。智慧如海。
自皈依僧。当愿众生。统理大众。一切无碍。
和南圣众。
十五、回向： 愿以此功德。庄严佛净土。
上报四重恩。下济三途苦。
若有见闻者。悉发菩提心。
尽此一报身。同生极乐国。
